Женский монастырь создан в 1683г. на месте скита мужского Троицкого монастыря в урочище "Каменная гора", где, по преданию, в XIV в. стоял город. В 1764г. - упразднен, в 1822 году восстановлен. К нач. ХХ в. многолюден. Территорию окружала ограда с башнями (1820-е) и многоярусной колокольней (1840-е - 1861). После революции преобразован в артель, окончательно закрыт в 1929, строения заняты под жилье. В 1970-80-х постройки в основном заброшены. Восстановление начато в кон. 1990-х, вновь открыт в 2004.
На территории женского монастыря находятся 2 храма.
Двухэтажный храм в честь Знамения Божией Матери был построен в 1813 году. 14 марта 1929 года пленум Елецкого горсовета единогласно принял решение о закрытии Знаменского монастыря и передаче его зданий под культурно-просветительские цели. Церковь обители была закрыта 2 мая 1929 года. В 1937 году начался процесс разрушения храма. В 1997 г. комплекс монастырских строений был передан Русской Православной Церкви в лице общины Вознесенского собора города Ельца. В 2005 г. началось восстановление Знаменского собора по чертежам, найденным в архивах. В декабре 2008 года восстановленный храм был освящен.
Весной 2006 г. по проекту архитектора А.В. Новосельцева в древней части монастыря, там, где до пожара 1769 г. стояла Никольская церковь, заложен деревянный храм во имя святителя Николая Чудотворца. Он выстроен за один строительный сезон и освящен Владыкой Никоном 31 декабря того же года. А.Новосельцев задумал храм в традициях старой русской деревянной архитектуры, поскольку как выглядела старая Никольская церковь, теперь сказать никто в точности не может. Сруб для храма рубили в Чаплыгине, главку изготовили на специализированном предприятии в Волгодонске, шатер и прочие деревянные работы делали мастера из Москвы. Чин освящения и первую литургию в новом храме служил епископ Липецкий и Елецкий Никон.
